通过购买或蓝图研究获得的舰船会直接存入玩家的舰船仓库。舰船仓库可通过主界面底部导航栏的舰船选项进入，此处会分类显示所有已拥有的舰船，包括战斗舰、工程舰和特殊舰种。购买后的舰船若未显示，需检查是否已完成建造流程或蓝图研究进度。部分高级舰船需满足基地等级条件才会解锁建造权限。
购买舰船的主要途径包括使用游戏内货币在商店直接购买蓝图箱，或通过完成特定任务获取限定舰船。蓝图箱开启后获得的舰船蓝图需在蓝图研究界面投入资源和技术值进行开发，研发完成后即可在舰船仓库中部署。部分活动限定舰船可能暂时无法通过常规渠道获取，需关注特殊活动通知。舰船仓库容量受基地等级影响，超出上限时需扩建或淘汰旧舰。
部署舰船需通过舰队管理界面操作。选择目标舰船后，可将其编入现有舰队或新建舰队，同时需分配指挥值。指挥值不足时需通过升级指挥中心或调整舰队配置解决。已部署的舰船会显示在星图上的基地或前哨站位置，移动舰队时需通过计划圈系统规划航线。若舰船在战斗中损毁，需返回基地或前哨站进行维修，维修期间无法调用。
舰船的实际应用场景包括资源采集、星系探索和战斗任务。工程舰需手动指派至资源点采集，战斗舰则可通过攻击指令参与PVE或PVP。部分高级舰船如航母需额外配置舰载机模块才能发挥完整功能。玩家可通过舰船详情页查看具体属性和技能，合理搭配舰种是提升战斗效率的关键。定期优化舰队配置能适应不同阶段的游戏需求。
