进入恐龙岛探险方舟的核心方式是点击城镇内摆放的传送门建筑，这是开启野外地图探索的必经入口。传送门通常位于主城区域的显眼位置，交互后会出现已解锁地点的列表界面，选择目标地点即可开始探险。需部分高级区域需要先提升杂货屋等级并击败前置首领BOSS才能解锁，这类限制会在地图信息界面明确标注。进入前建议检查队伍战力是否达到推荐数值，否则可能遭遇无法应对的危险生物。
探险模式分为自由探索和自动派遣两种形式，但后者需要先手动击败该区域的BOSS才能解锁。自由探索时玩家需手动控制角色采集资源、触发事件或挑战怪物，而派遣功能允许选择队员自动执行任务，期间该地图将无法手动进入。地图内不同颜色的箭头标记具有重要指引作用：橙色代表秘境传送门，蓝色为普通传送门，红色则标识BOSS位置，合理利用这些标记能显著提升探索效率。
资源采集是探险过程的基础环节，点击地图上的资源点会消耗体力获取装备制作材料。高等级地图的资源点往往需要先在工具坊升级对应采集工具才能交互，因此建议优先提升工具等级。野外雕像系统提供额外收益，使用圣水祈祷可获得炼金材料和种子，但若未使用圣水可能引发负面效果。随机刷新的宝箱需用对应钥匙开启，强行开启可能导致奖励降级或触发战斗。
