副本是获取资源和提升实力的重要途径，玩家可以通过日常活动界面直接进入庄园副本。这类副本通常全天开放，击败特定BOSS后可获得金条、装备等奖励。部分副本需要完成前置任务或达到一定等级才能解锁，例如大学副本要求角色等级达标并组建队伍。副本入口分散在不同地图中，如莱文市火车站、黑泥沼等区域，需先通关前置副本才能解锁后续内容。
多人副本如控制大楼需要采集等级达到91级且通关海岛暗礁后才能进入，这类副本通常需要破坏信号安全锁或启动卫星扫描等机制。危海寻晶副本则采用跨服匹配机制，玩家可根据自身采集等级选择难度，建议配备霰弹枪、蛛酶步枪等克制属性武器。团队协作在高级副本中尤为重要，例如控制大楼副本需分工破坏电网、收集卫星数据，并合理利用喷气背包等特殊道具。
部分副本设有独特环境机制，例如起源之地需持续点燃电灯驱散迷雾，否则会陷入迷失状态。山脚据点副本需布置定时炸弹并清理蜘蛛网，同时注意躲避感染体的抓取和跳砸攻击。幽灵据点等副本中存在纳米护盾机制，需先用冷兵器破除护盾再用枪支攻击。海域副本需避免落水，BOSS战阶段需根据属性克制更换武器，并注意躲避光圈等技能提示。
通关后奖励包括精密透镜、异变核芯宝箱等专属道具，部分副本还可获得配方资料和高级配件。建议每日优先完成危海寻晶等必打副本，通过交易市场出售稀有核芯获取金条。对于难度较高的副本，可先尝试低于自身等级的阶段熟悉机制，再逐步挑战更高难度。合理分配体力与补给物资，携带凝固剂、氨基酸营养液等消耗品能显著提升生存能力。
