元气骑士中存在多种特殊关卡，需要通过特定条件才能触发。这些隐藏关卡通常与地图场景、道具互动或解谜机制相关，完成挑战后可获得额外奖励或解锁特殊内容。触发方式因关卡类型而异，需结合场景特征和操作步骤才能成功进入。
墓穴隐藏关卡是遗迹场景的专属内容。进入遗迹地图后，需击败1-5关的BOSS并找到未标注的额外房间。房间内会出现石门机关，攻击触发后需完成符号连接谜题。谜题要求将相同符号的石块连线并填满所有格子，限时内完成即可开启传送门。若使用特定武器如一拳强行破坏石门，虽能进入但会触发特殊成就。墓穴地形存在深坑陷阱，掉落会扣血，全程无伤通关可解锁成就奖励。
沼泽隐藏关卡需在森林场景中寻找奉献池。通过向池中献祭武器积累点数，白色品质武器提供1点，绿色2点，依此类推。累计献祭值达到5点后，1-5关BOSS将固定变为变异哥布林祭祀。击败该BOSS后会出现紫色传送门，进入即可到达沼泽关卡。沼泽地形具有减速和下陷效果，部分护盾天赋可能失效，需提前做好战术准备。
沙漠隐藏关卡需要在地图中寻找特定机关。触发机关后会出现符咒连接挑战，需开启周围的小机关将所有符咒连通。该机制与墓穴谜题类似，但符咒排列方式更为复杂。成功连接后传送门开启，关卡内敌人强度和弹幕密度显著提升，建议携带范围型武器应对群体敌人。
神庙隐藏关卡采用快速连线解谜机制。门上的六个发光符号会随时间熄灭，需在限定时间内完成符号匹配。错误连接可退回修正，但总操作次数有限。该关卡对操作速度和逻辑判断有较高要求，失败后需重新挑战当前大关才能再次尝试。部分角色技能如道士的飞行能力可在关卡中规避地形伤害。
无限关卡需通过游戏大厅的古代传送门进入。切换为骑士角色后向左上方移动即可发现传送门，支付500金币后可进入特殊模式。该模式不受常规关卡进度限制，但敌人强度和资源消耗会随波次提升。合理搭配武器和天赋组合是维持持续作战的关键，建议优先选择能量利用率高的武器。
